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動畫制作在醫療領域方面，晦澀難懂的機械原理與人體內部結構是一個企業在推廣方面的難題。而通過三維動畫模擬，強悍的立體感使得平時肉眼看不見或實拍拍不著的人體內部世界、細胞的微觀世界，都能生動、形象地呈現在人們面前。
憑借著逼真形象的特質，三維動畫在醫療企業宣傳片、產品展示、廣告等方面得以應用。醫療器械的運行操作與工作原理、人體結構的分析、內部器官的展示、藥物帶來的化學反應與生理改變，一些現實生活中不好描述的原理，都能借助三維動畫的高仿真能力惟妙惟肖地展現出來。 在醫療教學中，對于一些抽象、復雜的現象，例如心臟血液的流動方向，老師掏心地表達換來的還是學生的不理解？別傷心！三維動畫能將這些看不見摸不著的主體物與動態過程具體化、形象化，呈現出事物現象的本質特征，語音難以表達的畫面不再是難題，形象的畫面讓學生更易理解記憶。
動畫制作在醫學研究與臨床中，三維動畫多角度、多層面的動態視頻打破溝通屏障，逼真的模型也為醫療手段的開發提供了交流的手段，醫師可通過三維動畫模擬的病人病變部位，對其進行剖析研究。此外，三維動畫可以突破時空模仿一些靜態圖像與現場難以呈現的人類生命現象，例如心跳、呼吸等運動狀態，再通過對治療過程進行科學的動畫還原，為病例剖析與治療方案提供“預演”機會，找出方案中不足的地方與錯誤操作并加以改善，降低風險。 而這些醫療過程三維演示動畫，也能將醫療情況展現在患者面前，讓患者對醫療過程有一個初步的理解，解決醫生與患者之間的溝通困難，也減少了患者對于手術中未知因素帶來的恐懼。
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